土木与交通学院现有6个省部级科研平台、1个省级协同创新中心，联合共建3个省部级科研平台，并与相关其他科研平台签订了科研合作协议，实现数据共享。此外，还建有6个校级科研平台。

6个省部级科研平台

黑龙江省道路结构与绿色生态技术重点实验室

黑龙江省桥梁施工控制与检测加固技术重点实验室

黑龙江省寒地道路交通运输技术重点实验室

黑龙江省东北多年冻土区道路低碳建设养护工程技术研究中心

黑龙江省中俄冻土科学与技术联合实验室（国际合作）

国家车辆事故深度调查体系工作站（NAIS）

1个省级协同创新中心

东北多年冻土区环境、道路建设与养护协同创新中心

3个联合共建省部级科研平台

东北多年冻土区地质环境系统教育部野外科学观测研究站（与东北林业大学林学院联合共建）

国家寒地低碳建筑技术研发中心（与黑龙江省寒地建筑科学研究院联合共建）

国家冰川冻土沙漠科学数据中心东北寒区工程与环境分中心（与中国科学院西北生态环境资源研究院共建）

6个校级科研平台

交通研究中心

冻土研究所

寒区科学与工程研究院

建筑结构研究所

风工程与防灾减灾研究中心

人工环境控制与能源应用研究所

    学院黑龙江省寒地道路交通运输技术重点实验室于2019年、黑龙江省道路结构与绿色生态技术重点实验室于2020年、黑龙江省桥梁施工控制与检测加固技术重点实验室于2020年、2022年获得黑龙江省科技创新基地奖励，发展态势良好。黑龙江省桥梁施工控制与检测加固技术重点实验室获省科技厅2023年报优秀（全省318家重点实验室参评，优秀为25项），是2023年东林唯一获优秀的省级科研平台。